养花网收获后及时深翻，深度要求20厘米以上，将菌核埋入深层；播前用10%盐水漂种2—3次，除去菌核。采用紫外线塑料膜高畦覆盖，抑制菌源；种子和土壤消毒，种植前每亩用20%甲基立枯磷0.5千克对细土20千克配成药土，拌匀撒施。种子用50℃温水浸种10分钟，即可杀死菌核；露地出现子囊盘时，喷撒5%百菌清粉尘剂，每亩用1千克，或用50%扑海因或50%农利灵可湿性粉剂1000倍液、20%甲基立枯磷乳油1000倍液、50%扑海因可湿性粉剂1500倍液加30%甲基硫菌灵（甲基托布津）可湿性粉剂1000倍液于盛花期喷雾，隔7—8天喷1次，连续防治3—4次；在土壤中撒施石灰，可明显抑制菌核病的发生。
首先要选用抗病优良品种；选用无病菌的蒜种；适时播种，合理密植，施足底肥；发病初期用多菌灵或菌核净等隔一周再喷一次，效果较好。
菌核病：低温高湿，光照不足易发生，湿度大时有灰色霉层，伴随病部干枯，在生长期间及时摘除病果、病花、病叶，轻摘轻拿，集中销毁，减少扩散。清洁田园是减少初侵染和再侵染的关键。如果已经发病，建议用35%腐霉.或啶酰菌胺，或40%嘧霉胺，或多抗霉素，病害严重时2种复配，或加大剂量。并及时补充硼，钙等微量元素。
药剂拌种，在种植前，将大蒜种子采用300倍液70%甲基托布津+2000倍液爱多收，进行浸种3~5个小时，然后进行种植，可对苗期的菌核病，有一定的防效。
建议用35%腐霉.异菌脲（克灰利），或啶酰菌胺，或40%嘧霉胺（点峰），或50%异菌脲（扑果因），或50%腐霉利，或50%咯菌腈（卉友），或多抗霉素，或菌核净，或70%甲基硫菌灵交替用药喷施，病害严重时2种复配，或加大剂量。并及时补充硼，钙等微量元素。
大蒜叶枯病、叶斑病类、白腐病、菌核病等病害的病原物都是随病株残体在土壤中越冬越夏，应彻底清理病株残体，同时实行3年以上轮作倒茬。
春季发病初盛时，一般在3月下旬，用50％速克灵粉剂1500倍液，或50％多菌灵粉剂500倍喷雾防治，施药时重喷茎基部，隔7～10天喷1次，连续防治2～3次。
大蒜菌核病发病初期用50%速克灵可湿性粉剂1500倍液、50%多菌灵可湿性粉剂500倍液、40%菌核净可湿性粉剂800倍液、70%甲基托布津可湿性粉剂喷雾防治，重点喷茎基部，隔7-10天喷1次，连续防治2-3次。
发病初期用50%速克灵可湿性粉剂1500倍液、50%多菌灵可湿性粉剂500倍液、40%菌核净可湿性粉剂800倍液、70%甲基托布津可湿性粉剂喷雾防治，重点喷茎基部，隔7－10天喷1次，连续防治2－3次，效果更佳。加强田间管理，合理浇水，科学使用农药。
